24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3268 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3268  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 120 aa  253  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68542  normal  0.310475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2700  antibiotic biosynthesis monooxygenase  85.22 
 
 		 129 aa  216  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.420345  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1714  antibiotic biosynthesis monooxygenase  68.7 
 
 		 116 aa  183  6e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00170627  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2799  antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.41 
 
 		 115 aa  140  4e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.584286  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0932  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.75 
 
 		 116 aa  136  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.127938  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.98 
 
 		 117 aa  134  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 		 105 aa  57  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  36.47 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3506  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  34.94 
 
 		 112 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  31.71 
 
 		 108 aa  47  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 		 108 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.7 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.87 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  30.99 
 
 		 94 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.26 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  32.14 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>