44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1714 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_1714  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
116 aa  243  6.999999999999999e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00170627  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3268  antibiotic biosynthesis monooxygenase  68.7 
 
 
120 aa  183  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68542  normal  0.310475 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2700  antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.09 
 
 
129 aa  179  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.420345  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2799  antibiotic biosynthesis monooxygenase  56.64 
 
 
115 aa  138  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.584286  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0932  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.21 
 
 
116 aa  127  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.127938  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.56 
 
 
117 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.14 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  35 
 
 
105 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3506  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
108 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
108 aa  52  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
108 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
108 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
108 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
108 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  35 
 
 
108 aa  51.2  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  31.71 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  32.94 
 
 
112 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.53 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 
98 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  37.5 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.71 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1214  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.85027  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.1 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.06 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 
98 aa  41.2  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.72 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
102 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  30.77 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
96 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>