93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1296 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
102 aa  202  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5255  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.36 
 
 
102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.083215  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3791  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.12 
 
 
101 aa  89.7  1e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1214  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.14 
 
 
110 aa  89.7  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.85027  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3875  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.12 
 
 
101 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.988198 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4261  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.16 
 
 
102 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.899897  hitchhiker  0.000276374 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3317  quinol monooxygenase YgiN  36.89 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0938653 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3207  quinol monooxygenase YgiN  35.92 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3462  quinol monooxygenase YgiN  35.92 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3437  hypothetical protein  37.25 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368327  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3493  quinol monooxygenase YgiN  35.92 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3430  hypothetical protein  37.25 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3365  protein YgiN  37.25 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02901  quinol monooxygenase  35.92 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0668  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.92 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541585 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3361  protein YgiN  37.25 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218693  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3532  hypothetical protein  37.25 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4337  quinol monooxygenase YgiN  35.92 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0671  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.92 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02851  hypothetical protein  35.92 
 
 
104 aa  63.9  0.0000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
101 aa  63.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  36.73 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3432  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.31 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.14 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  33.7 
 
 
98 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  39.19 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.31 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.32 
 
 
114 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  32.53 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.67 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.67 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.67 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.05 
 
 
98 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.65 
 
 
94 aa  50.8  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.67 
 
 
94 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2120  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.35 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.35 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.35 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3995  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.64 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.261121 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.07 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.52 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07090  hypothetical protein  36.36 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.7 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.67 
 
 
94 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  32.65 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12762  hypothetical protein  34.34 
 
 
104 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.21885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.35 
 
 
104 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.63 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.65 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.31 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.31 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.45 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.61 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  30 
 
 
106 aa  45.1  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 
95 aa  45.1  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.37 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  30.3 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.31 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  31.25 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.31 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2799  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.72 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.584286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
101 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.11 
 
 
110 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.1 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.31 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  30.39 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  36.71 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.3 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 
104 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 
98 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 
104 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6175  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 
106 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0846  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
103 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 
103 aa  41.2  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 
103 aa  40.8  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1714  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
116 aa  40.4  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00170627  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3001  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
93 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107557  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  29.07 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.67 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>