59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5255 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5255  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 102 aa  203  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.083215  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.36 
 
 		 102 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3317  quinol monooxygenase YgiN  46.15 
 
 		 104 aa  80.1  0.000000000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0938653 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0671  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.19 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02851  hypothetical protein  45.19 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4337  quinol monooxygenase YgiN  45.19 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3462  quinol monooxygenase YgiN  45.19 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0668  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.19 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541585 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3493  quinol monooxygenase YgiN  45.19 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3207  quinol monooxygenase YgiN  45.19 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02901  quinol monooxygenase  45.19 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3532  hypothetical protein  44.66 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3437  hypothetical protein  44.66 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3430  hypothetical protein  44.66 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3365  protein YgiN  44.66 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3361  protein YgiN  44.66 
 
 		 104 aa  77.8  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218693  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3432  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.66 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1214  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.62 
 
 		 110 aa  73.6  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.85027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3875  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.988198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3791  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4261  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41 
 
 		 102 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.899897  hitchhiker  0.000276374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.02 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.28 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.59 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.32 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  30.77 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.07 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.61 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  28.71 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.04 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.69 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.72 
 
 		 106 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 		 104 aa  43.9  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  36.71 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.52 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 		 98 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  36.49 
 
 		 95 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.63 
 
 		 106 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.72 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1075  hypothetical protein  33.68 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1906  lipoprotein  33.68 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  33.68 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  33.68 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  33.68 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  33.68 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  33.68 
 
 		 96 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.73 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  26.73 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 		 103 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.07 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>