48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3317 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3317  quinol monooxygenase YgiN  100 
 
 		 104 aa  216  7.999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0938653 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0671  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  99.04 
 
 		 104 aa  215  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02851  hypothetical protein  99.04 
 
 		 104 aa  215  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4337  quinol monooxygenase YgiN  99.04 
 
 		 104 aa  215  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3462  quinol monooxygenase YgiN  99.04 
 
 		 104 aa  215  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02901  quinol monooxygenase  99.04 
 
 		 104 aa  215  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0668  antibiotic biosynthesis monooxygenase  99.04 
 
 		 104 aa  215  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541585 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3493  quinol monooxygenase YgiN  99.04 
 
 		 104 aa  215  1e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3207  quinol monooxygenase YgiN  99.04 
 
 		 104 aa  215  1e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3532  hypothetical protein  89.42 
 
 		 104 aa  199  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3361  protein YgiN  89.42 
 
 		 104 aa  199  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3365  protein YgiN  89.42 
 
 		 104 aa  199  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3430  hypothetical protein  89.42 
 
 		 104 aa  199  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3437  hypothetical protein  89.42 
 
 		 104 aa  199  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3432  antibiotic biosynthesis monooxygenase  79.81 
 
 		 104 aa  184  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4261  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47 
 
 		 102 aa  101  3e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.899897  hitchhiker  0.000276374 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1214  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.56 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.85027  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5255  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.15 
 
 		 102 aa  80.1  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.083215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3875  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.63 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.988198 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3791  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.64 
 
 		 101 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.65 
 
 		 101 aa  72.4  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.89 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.04 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.18 
 
 		 103 aa  51.6  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  34.34 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.16 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.53 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  31.25 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.62 
 
 		 101 aa  45.1  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  31.52 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.48 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.52 
 
 		 110 aa  41.6  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.69 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.63 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 		 95 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0948  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.05 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  31.76 
 
 		 94 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3001  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107557  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  31.03 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 		 94 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>