178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0852 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  100 
 
 		 96 aa  197  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  67.02 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.68 
 
 		 96 aa  114  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.74 
 
 		 96 aa  113  7.999999999999999e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.04 
 
 		 100 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.04 
 
 		 96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.85 
 
 		 112 aa  110  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.04 
 
 		 96 aa  108  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  48.42 
 
 		 96 aa  107  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.61 
 
 		 95 aa  107  8.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.71 
 
 		 96 aa  100  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.9 
 
 		 94 aa  98.6  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.58 
 
 		 96 aa  86.7  1e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.86 
 
 		 97 aa  85.1  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 		 96 aa  81.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  48.42 
 
 		 96 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.24 
 
 		 99 aa  78.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.56 
 
 		 95 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  38.71 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.24 
 
 		 106 aa  73.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 99 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  38.71 
 
 		 95 aa  73.9  0.0000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.68 
 
 		 99 aa  72.8  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.37 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.11 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.37 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.37 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.71 
 
 		 107 aa  72  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.37 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.33 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.3 
 
 		 106 aa  69.3  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  46.75 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.56 
 
 		 97 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.53 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  32.63 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  32.63 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  38.54 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.8 
 
 		 94 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  39.24 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.8 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  31.25 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 100 aa  60.1  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1075  hypothetical protein  39.58 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1906  lipoprotein  39.58 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  39.58 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  39.58 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  39.58 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  39.58 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  39.58 
 
 		 96 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  35.14 
 
 		 94 aa  59.3  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 		 95 aa  58.9  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2577  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  39.58 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.53 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 		 148 aa  57.8  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  33.67 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.19 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  35.9 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.18 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 		 94 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.18 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.18 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.38 
 
 		 95 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.65 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  33.77 
 
 		 98 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  29.35 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  32 
 
 		 95 aa  53.5  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.91 
 
 		 114 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  36 
 
 		 101 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3995  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.74 
 
 		 104 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.261121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 		 103 aa  50.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38 
 
 		 98 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.33 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.82 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1390  hypothetical protein  51.22 
 
 		 41 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.391611  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 107 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 103 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 		 128 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.04 
 
 		 99 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 		 94 aa  47  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>