137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0454 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
106 aa  209  9e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0846  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 
103 aa  96.7  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2120  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.54 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.54 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.54 
 
 
104 aa  91.3  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12762  hypothetical protein  43.69 
 
 
104 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.21885 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.54 
 
 
104 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3995  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.66 
 
 
104 aa  82.4  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.261121 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3607  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.56 
 
 
103 aa  81.6  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3001  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.33 
 
 
93 aa  67.4  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107557  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07090  hypothetical protein  38.83 
 
 
103 aa  67  0.00000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  39.02 
 
 
95 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.56 
 
 
97 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.96 
 
 
103 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0205847  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.63 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.22 
 
 
92 aa  60.5  0.000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000542689 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
98 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.37 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  30.91 
 
 
112 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.73 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3067  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.05 
 
 
92 aa  57  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.299855  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  34.83 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
99 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04800  hypothetical protein  37.62 
 
 
103 aa  53.9  0.0000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.574868  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.52 
 
 
99 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  32.1 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.35 
 
 
114 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
80 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.21 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  35.44 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.1 
 
 
96 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
96 aa  50.4  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.76 
 
 
96 aa  50.1  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  26.37 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  29.79 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  31.76 
 
 
99 aa  48.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.74 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.37 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.1 
 
 
106 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  29.07 
 
 
96 aa  47  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.26 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.59 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.84 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0549  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.99 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3875  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
101 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.988198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  26.51 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  26.51 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.04 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3791  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  23.08 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  23.08 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.09 
 
 
101 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  23.08 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  28.72 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  23.08 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.39 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21560  hypothetical protein  28.87 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.61 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.29 
 
 
96 aa  42.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  23.08 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  31.4 
 
 
96 aa  42.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.61 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1401  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02901  quinol monooxygenase  34.07 
 
 
104 aa  42  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0671  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.07 
 
 
104 aa  42  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  27.59 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  28.75 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.47 
 
 
95 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3411  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.17 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4337  quinol monooxygenase YgiN  34.07 
 
 
104 aa  42  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.12 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.61 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02851  hypothetical protein  34.07 
 
 
104 aa  42  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3393  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0668  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.07 
 
 
104 aa  42  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541585 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3317  quinol monooxygenase YgiN  33.33 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0938653 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  23.46 
 
 
94 aa  42  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3918  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.17 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0584952  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3462  quinol monooxygenase YgiN  34.07 
 
 
104 aa  42  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>