69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1214 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1214  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
110 aa  222  2e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.85027  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3791  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.52 
 
 
101 aa  108  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3875  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.51 
 
 
101 aa  107  4.0000000000000004e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.988198 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.14 
 
 
102 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.39 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3317  quinol monooxygenase YgiN  43.56 
 
 
104 aa  80.5  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0938653 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3207  quinol monooxygenase YgiN  42.57 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3493  quinol monooxygenase YgiN  42.57 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02901  quinol monooxygenase  42.57 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0668  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.57 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00541585 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3462  quinol monooxygenase YgiN  42.57 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4337  quinol monooxygenase YgiN  42.57 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02851  hypothetical protein  42.57 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0671  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.57 
 
 
104 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3365  protein YgiN  39.81 
 
 
104 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3430  hypothetical protein  39.81 
 
 
104 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3437  hypothetical protein  39.81 
 
 
104 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368327  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3361  protein YgiN  39.81 
 
 
104 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218693  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3532  hypothetical protein  39.81 
 
 
104 aa  77  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5255  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.62 
 
 
102 aa  73.6  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.083215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4261  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.62 
 
 
102 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.899897  hitchhiker  0.000276374 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3432  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.62 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.03 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  30.39 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  31.96 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.61 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.61 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.28 
 
 
96 aa  47  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.3 
 
 
96 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 
97 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1276  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.3 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.72 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.31 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  30.68 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
117 aa  45.4  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.47 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0407  antibiotic biosynthesis monooxygenase  21.21 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  28.72 
 
 
94 aa  44.3  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.38 
 
 
93 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.72 
 
 
94 aa  44.3  0.0007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.34 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.37 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1714  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 
116 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00170627  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1513  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.09 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289391  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  28.16 
 
 
101 aa  42.4  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2799  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.38 
 
 
115 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.584286  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
110 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2292  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.38 
 
 
99 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  26.61 
 
 
112 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
106 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2802  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.38 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.7 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 
98 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3001  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.25 
 
 
93 aa  40.4  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107557  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>