167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3744 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
95 aa  200  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.55 
 
 
100 aa  94  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.53 
 
 
99 aa  83.6  8e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.13 
 
 
148 aa  83.2  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.55 
 
 
99 aa  73.6  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  32.98 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  34.15 
 
 
98 aa  63.9  0.0000000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.97 
 
 
97 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  63.5  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.99 
 
 
96 aa  62  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
97 aa  61.6  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  35.56 
 
 
94 aa  61.2  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  34.48 
 
 
102 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.9 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 
110 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 
97 aa  59.3  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 
95 aa  59.3  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  31.82 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  34.94 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
106 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.94 
 
 
128 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.33 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  34.18 
 
 
94 aa  57.4  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4464  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
117 aa  57  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.293182  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1037  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 
97 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673583  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  36.25 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4416  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
97 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814561  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1396  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.340093  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.22 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4327  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.398506 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3239  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  44.07 
 
 
98 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  36.99 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.53 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  36.99 
 
 
97 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  37.18 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  30.38 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
98 aa  54.3  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 
102 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.09 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 
96 aa  53.5  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.17 
 
 
112 aa  53.5  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  34.25 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.92 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.05 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  35.56 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 
99 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
96 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.82 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  29.33 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.82 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 
99 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  39.39 
 
 
101 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.34 
 
 
104 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
114 aa  48.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
101 aa  48.9  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  34.18 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.14 
 
 
95 aa  47.8  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 
99 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  31.25 
 
 
112 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.68 
 
 
96 aa  47.4  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 
96 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6125  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.22 
 
 
108 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440027  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 
96 aa  47  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38020  putative ntibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 
135 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109734  hitchhiker  0.00690857 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1214  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.85027  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.31 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  31.15 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.39 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0349  hypothetical protein  27.91 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>