106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0405 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  78.85 
 
 		 108 aa  177  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  78.85 
 
 		 108 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  78.85 
 
 		 108 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  78.85 
 
 		 108 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  78.85 
 
 		 108 aa  176  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  77.14 
 
 		 108 aa  176  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  77.67 
 
 		 108 aa  174  5e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  76.7 
 
 		 108 aa  173  9e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3506  antibiotic biosynthesis monooxygenase  74.29 
 
 		 108 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.5 
 
 		 105 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.51 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2799  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.65 
 
 		 115 aa  60.8  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.584286  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.94 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.93 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  41.94 
 
 		 94 aa  57  0.00000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 		 97 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.84 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  32.63 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3268  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.47 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68542  normal  0.310475 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.71 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  44.26 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0932  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.07 
 
 		 116 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.127938  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1714  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00170627  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.04 
 
 		 99 aa  52  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.56 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.98 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2700  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.420345  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.04 
 
 		 107 aa  51.2  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.44 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 100 aa  50.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  41.33 
 
 		 102 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.68 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  37.5 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.85 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  26.26 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1075  hypothetical protein  39.29 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1906  lipoprotein  39.29 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2577  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  39.29 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  39.29 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  39.29 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  39.29 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  39.29 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  39.29 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  36.92 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.91 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  33.33 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.59 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.85 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.35 
 
 		 94 aa  45.4  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.11 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.81 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.51 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.07 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.35 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  29.41 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.03 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 		 101 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 		 112 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07090  hypothetical protein  33.73 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  39.19 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.37 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1144  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.51 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  0.57363 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0414  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 		 97 aa  42  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  34.04 
 
 		 128 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 		 99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.85 
 
 		 95 aa  42  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.16 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  29.41 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.07 
 
 		 148 aa  41.6  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.15 
 
 		 99 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.27 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1468  hypothetical protein  30.16 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>