105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1144 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1144  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 107 aa  221  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  0.57363 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.96 
 
 		 99 aa  97.8  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.94 
 
 		 99 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.88 
 
 		 99 aa  93.6  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.84 
 
 		 99 aa  88.2  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.84 
 
 		 99 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.84 
 
 		 99 aa  87  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.88 
 
 		 99 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  36.59 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  37.89 
 
 		 101 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.63 
 
 		 102 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  30.68 
 
 		 97 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  44.29 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  44.29 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.9 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.9 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.11 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.11 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.74 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  28.41 
 
 		 97 aa  52  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  37.23 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.11 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.11 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.36 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.11 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  45.76 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0549  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.59 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.96 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  36.9 
 
 		 272 aa  50.4  0.000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  27.27 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.04 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  40.58 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.52 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.58 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  27.59 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.96 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.14 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 95 aa  47.8  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  25 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  25 
 
 		 97 aa  47  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  25 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.67 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  29.79 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  31.51 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  31.51 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  25 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  32.14 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  25 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.71 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  37.84 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.79 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.51 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 95 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  31.91 
 
 		 117 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 		 95 aa  43.5  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  30.12 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3695  GCN5-related N-acetyltransferase  51.06 
 
 		 269 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.304884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.74 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  31.46 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 		 108 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  35.62 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.68 
 
 		 108 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.73 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  36.51 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1276  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.37 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.44 
 
 		 99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.1 
 
 		 95 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 		 108 aa  42  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 		 104 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 103 aa  41.6  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.92 
 
 		 101 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.26 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4618  hypothetical protein  27.91 
 
 		 92 aa  41.2  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.44 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.44 
 
 		 99 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.53 
 
 		 97 aa  40.4  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>