171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2182 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
103 aa  213  5e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.63 
 
 
103 aa  142  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
99 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.78 
 
 
110 aa  86.7  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
104 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.78 
 
 
104 aa  70.1  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.98 
 
 
106 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.47 
 
 
98 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  34.29 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21560  hypothetical protein  34.74 
 
 
104 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.29 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 
102 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.59 
 
 
96 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  35.71 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  27.55 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
99 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.52 
 
 
105 aa  59.7  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1803  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
97 aa  57.4  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.8 
 
 
106 aa  57.4  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0214  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.79 
 
 
100 aa  57.4  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
112 aa  57  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.71 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.71 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.71 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 
94 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.71 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.71 
 
 
108 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 
94 aa  57  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
94 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.31 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  35.44 
 
 
108 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  32.98 
 
 
102 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
94 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.44 
 
 
108 aa  54.7  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.3 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
99 aa  53.9  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
100 aa  54.3  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
100 aa  53.9  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  47.06 
 
 
94 aa  53.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.96 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.96 
 
 
99 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3506  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 
108 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
96 aa  52.8  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  32.97 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.94 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  30.77 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  33.82 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 
101 aa  51.2  0.000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  31.34 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  31.08 
 
 
106 aa  51.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  35.44 
 
 
105 aa  51.2  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.25 
 
 
114 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 
95 aa  50.4  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  38.71 
 
 
94 aa  50.8  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  32.43 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.86 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  50.4  0.000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.12 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4618  hypothetical protein  24.42 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  31.94 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  39.13 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.96 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  32.63 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  39.13 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.35 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.97 
 
 
101 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  32.43 
 
 
96 aa  48.9  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0828  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.14 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0989333  normal  0.0109928 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.74 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  28.41 
 
 
99 aa  47.8  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.85 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.35 
 
 
98 aa  47  0.00008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 
101 aa  47  0.00008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.33 
 
 
95 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
99 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4464  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
117 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.293182  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>