96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0502 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 105 aa  216  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  73.33 
 
 		 108 aa  166  1e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  74.04 
 
 		 108 aa  165  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  72.12 
 
 		 108 aa  164  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  72.82 
 
 		 108 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  72.82 
 
 		 108 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  72.82 
 
 		 108 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  72.82 
 
 		 108 aa  163  9e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  71.15 
 
 		 108 aa  159  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3506  antibiotic biosynthesis monooxygenase  70.19 
 
 		 108 aa  157  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  62.5 
 
 		 105 aa  143  8.000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.9 
 
 		 117 aa  63.9  0.0000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1714  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.14 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00170627  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.52 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2799  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 		 115 aa  59.7  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.584286  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0932  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 		 116 aa  58.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.127938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2700  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.94 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.420345  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3268  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 		 120 aa  57  0.00000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68542  normal  0.310475 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.81 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 94 aa  57  0.00000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 95 aa  56.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.71 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  45.31 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  32.22 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.71 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.82 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  36.76 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.59 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.13 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  31.58 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.88 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  30.21 
 
 		 112 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.34 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  37.66 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.53 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.08 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.65 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.31 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.85 
 
 		 114 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.91 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3607  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.58 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.88 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.72 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 		 96 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.05 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.34 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.12 
 
 		 97 aa  43.9  0.0008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 		 99 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  29.67 
 
 		 106 aa  43.5  0.0009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.71 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  34.43 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.92 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  26.92 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 		 99 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  26.92 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  28.92 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.39 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0414  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.92 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  31.51 
 
 		 99 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 		 95 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.58 
 
 		 99 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  25 
 
 		 98 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3852  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 101 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.108914  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.8 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 102 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.3 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 		 93 aa  40  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>