128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5219 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 100 aa  211  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.55 
 
 		 95 aa  94  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.74 
 
 		 148 aa  83.6  9e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.74 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.42 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.05 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  39.08 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.18 
 
 		 100 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 		 95 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  35 
 
 		 96 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 106 aa  62  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  39.73 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  39.73 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.39 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 		 99 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.1 
 
 		 106 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.06 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4464  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 		 117 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.293182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.44 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 		 99 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  36.07 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.5 
 
 		 99 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.71 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 		 108 aa  52.8  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 		 108 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  31.08 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  32.98 
 
 		 105 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 		 94 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 		 108 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 		 94 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3506  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 		 108 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  29.87 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  31.46 
 
 		 108 aa  51.2  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.08 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1075  hypothetical protein  37.93 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1906  lipoprotein  37.93 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2577  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  37.93 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03520  hypothetical protein  31.94 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0684693  hitchhiker  0.0000000000000234077 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  37.93 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  37.93 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  37.93 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  37.93 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  37.93 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  27.27 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38020  putative ntibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109734  hitchhiker  0.00690857 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  29.87 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 		 95 aa  48.1  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.33 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.58 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  29.55 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  27.85 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3239  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  31.94 
 
 		 98 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.71 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 98 aa  47  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 101 aa  47  0.00009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.26 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  26.32 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.92 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.22 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1396  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.340093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4327  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.398506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4416  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1037  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  31.43 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  21.84 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.21 
 
 		 95 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  21.84 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  24.36 
 
 		 106 aa  44.7  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2267  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.31 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>