135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_0579 on replicon NC_009456
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  100 
 
 		 96 aa  196  6e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  58.33 
 
 		 96 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  58.33 
 
 		 96 aa  118  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.41 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  34.41 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  34.41 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.41 
 
 		 95 aa  64.3  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  41.67 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  37.21 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  37.21 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.04 
 
 		 97 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.44 
 
 		 97 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.7 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.7 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.53 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.7 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  39.44 
 
 		 94 aa  60.5  0.000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  34.88 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.48 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.39 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.33 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.89 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  30.38 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  35.9 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  31.52 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.91 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  34.18 
 
 		 112 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  36.25 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 		 110 aa  55.5  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  39.44 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  36.25 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  36.25 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  36.25 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  37.65 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.65 
 
 		 128 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 		 99 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.13 
 
 		 96 aa  53.1  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  31.17 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  32.47 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.11 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.05 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.25 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  32.05 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  32.91 
 
 		 102 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  35 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  34.57 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 		 99 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  33.73 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.59 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  33.73 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.53 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.85 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 		 102 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.04 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21560  hypothetical protein  33.68 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  31.25 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  33.8 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3393  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.79 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.58 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.53 
 
 		 99 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  31.51 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.87 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2802  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.37 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  30.38 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.31 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2319  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 114 aa  45.4  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>