48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4464 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4464  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
117 aa  242  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.293182  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4327  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.86 
 
 
97 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.398506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4416  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.86 
 
 
97 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814561  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1037  antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.84 
 
 
97 aa  132  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673583  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1396  antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.82 
 
 
97 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.340093  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38020  putative ntibiotic biosynthesis monooxygenase  41.18 
 
 
135 aa  79.3  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109734  hitchhiker  0.00690857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.66 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03520  hypothetical protein  37.93 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0684693  hitchhiker  0.0000000000000234077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3203  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0128799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3239  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  36.36 
 
 
98 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0349  hypothetical protein  35.63 
 
 
94 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29 
 
 
128 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.35 
 
 
106 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
98 aa  50.4  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  28.28 
 
 
128 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.37 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.5 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.97 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0214  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.61 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2637  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.34 
 
 
99 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.51631  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
103 aa  46.6  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.92 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.47 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.53 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.92 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.03 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0948  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.58 
 
 
115 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.88 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.33 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.33 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  29.17 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.51 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  25 
 
 
106 aa  41.2  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  25 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.78 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.3 
 
 
94 aa  40.4  0.007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.64 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  25.56 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  25.56 
 
 
97 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>