163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001135 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  200  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  70.83 
 
 
96 aa  149  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  58.33 
 
 
96 aa  123  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.89 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.77 
 
 
99 aa  72.4  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.56 
 
 
96 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.56 
 
 
96 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.56 
 
 
96 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  39.33 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
96 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 
104 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.44 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.36 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.24 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  39.24 
 
 
94 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
97 aa  62.8  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.99 
 
 
104 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 
106 aa  62  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.74 
 
 
95 aa  62  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  36.05 
 
 
94 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  39.24 
 
 
96 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.87 
 
 
96 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.9 
 
 
95 aa  60.8  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  39.74 
 
 
96 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
107 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.75 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.13 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
99 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  36.71 
 
 
96 aa  58.2  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  31.58 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  31.58 
 
 
95 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.53 
 
 
98 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.25 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 
104 aa  57  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.84 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  36.71 
 
 
112 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  35.14 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.26 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.82 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.9 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.53 
 
 
112 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.93 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
95 aa  55.5  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 
99 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.44 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  32.47 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
95 aa  52.8  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  35.62 
 
 
102 aa  52  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.95 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.63 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.53 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.34 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.38 
 
 
114 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  38.03 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 
106 aa  50.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
98 aa  50.8  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
95 aa  50.8  0.000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1075  hypothetical protein  35.96 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  31.65 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1906  lipoprotein  35.96 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  44 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2577  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.79 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.21 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.96 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.96 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.96 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.96 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.96 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2319  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.21 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.49 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  33.8 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1880  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.85 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.63 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  33.8 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21560  hypothetical protein  36.99 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>