32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4327 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009512  Pput_4327  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
97 aa  196  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.398506 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1396  antibiotic biosynthesis monooxygenase  98.97 
 
 
97 aa  194  3e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.340093  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4416  antibiotic biosynthesis monooxygenase  98.97 
 
 
97 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814561  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1037  antibiotic biosynthesis monooxygenase  92.71 
 
 
97 aa  179  8.000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673583  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4464  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.86 
 
 
117 aa  134  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.293182  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38020  putative ntibiotic biosynthesis monooxygenase  40.23 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109734  hitchhiker  0.00690857 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.44 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03520  hypothetical protein  39.08 
 
 
94 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0684693  hitchhiker  0.0000000000000234077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3203  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.91 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0128799 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0349  hypothetical protein  37.93 
 
 
94 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3239  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  33.33 
 
 
98 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 
94 aa  52  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  32.58 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 
94 aa  44.7  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.51 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 
106 aa  42.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.17 
 
 
104 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.03 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.17 
 
 
104 aa  42  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.17 
 
 
104 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 
114 aa  41.6  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  29.41 
 
 
97 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.84 
 
 
94 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  29.41 
 
 
97 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 
94 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  25.32 
 
 
102 aa  40.4  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>