215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4662 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 104 aa  214  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  99.04 
 
 		 104 aa  212  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  93.27 
 
 		 104 aa  202  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  85.58 
 
 		 104 aa  187  4e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  70.19 
 
 		 104 aa  157  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  68.09 
 
 		 98 aa  140  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.45 
 
 		 103 aa  76.6  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.35 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  39.73 
 
 		 96 aa  66.6  0.00000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.69 
 
 		 97 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21560  hypothetical protein  38.46 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.52 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.94 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  38.96 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  38.96 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.33 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.59 
 
 		 95 aa  61.2  0.000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.33 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  35.14 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  43.86 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.42 
 
 		 95 aa  57  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  41.18 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  39.71 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  31.4 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 		 94 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.99 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.33 
 
 		 95 aa  55.1  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.22 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  28.24 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  39.73 
 
 		 98 aa  54.3  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 		 101 aa  54.3  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 107 aa  53.9  0.0000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  40 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  30.12 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  36.84 
 
 		 102 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.82 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.44 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 		 114 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.67 
 
 		 110 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.7 
 
 		 96 aa  52.8  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.07 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  30.77 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 		 98 aa  52.4  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  31.17 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  31.94 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.73 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.96 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  27.85 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 		 96 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.49 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.66 
 
 		 109 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  38.57 
 
 		 112 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  28.21 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  28.21 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2120  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0214  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 100 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  28.21 
 
 		 97 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.22 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.87 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  28.21 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  28.21 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  28.21 
 
 		 97 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.59 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3995  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.34 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.261121 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.58 
 
 		 97 aa  50.4  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  38.36 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 		 102 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1803  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.84 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12762  hypothetical protein  26.73 
 
 		 104 aa  50.1  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.21885 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  31.08 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>