144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3005 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
101 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  89.11 
 
 
101 aa  191  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  77.17 
 
 
96 aa  159  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  71.28 
 
 
99 aa  149  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.96 
 
 
95 aa  139  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  65.26 
 
 
95 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  65.26 
 
 
95 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  67.03 
 
 
95 aa  130  5e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  30.95 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.66 
 
 
99 aa  64.7  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.33 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.33 
 
 
104 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.02 
 
 
111 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.1 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.1 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.1 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.1 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  35 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 
95 aa  58.2  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.02 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3918  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0584952  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3411  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 
111 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  34.25 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.82 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.33 
 
 
104 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 
99 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  34.18 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  34.18 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  32.18 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0164  hypothetical protein  64.71 
 
 
35 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471124 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  35.9 
 
 
98 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
96 aa  51.6  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
97 aa  51.2  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.99 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
94 aa  50.8  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  30.23 
 
 
95 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3638  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  32.18 
 
 
96 aa  50.4  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 
112 aa  50.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  30 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
100 aa  49.7  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 
93 aa  49.3  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.68 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.97 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0948  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  31.17 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.11 
 
 
99 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.38 
 
 
95 aa  47.8  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 
99 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1439  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.85 
 
 
98 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.31 
 
 
103 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.38 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  37.33 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.38 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.33 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.87 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  37.5 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  37.5 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.74 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.5 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.35 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2120  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.14 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 
128 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.1 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.35 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.54 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3852  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.92 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.108914  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>