142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1406 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
96 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.62 
 
 
100 aa  138  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  62.11 
 
 
96 aa  133  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  60 
 
 
96 aa  129  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.42 
 
 
96 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  61.54 
 
 
112 aa  127  4.0000000000000003e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  51.04 
 
 
96 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  56.67 
 
 
96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.11 
 
 
96 aa  95.5  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.16 
 
 
96 aa  86.3  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.01 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.78 
 
 
97 aa  80.9  0.000000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  34.41 
 
 
96 aa  80.5  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.04 
 
 
94 aa  77  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
99 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
99 aa  67.8  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.42 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.94 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  32.26 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  32.26 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 
95 aa  63.9  0.0000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
95 aa  62.8  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  36.56 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 
106 aa  60.5  0.000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.94 
 
 
106 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
95 aa  60.5  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.23 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1390  hypothetical protein  65.85 
 
 
41 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.391611  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  42.67 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 
94 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
97 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  32.53 
 
 
94 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  35.53 
 
 
96 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 
94 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  31.18 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
100 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  36.49 
 
 
94 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  29.21 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  29.21 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
97 aa  54.3  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
101 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 
107 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  32.47 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 
96 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
114 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
95 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.06 
 
 
148 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  32.93 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.08 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  30 
 
 
98 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1075  hypothetical protein  39.66 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1906  lipoprotein  39.66 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  39.66 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  39.66 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  39.66 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  39.66 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  39.66 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  34.78 
 
 
112 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  31.43 
 
 
98 aa  47.4  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4618  hypothetical protein  34.18 
 
 
92 aa  47.4  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.68 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
98 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2577  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  39.66 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.4 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.77 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.4 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.77 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.77 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.77 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.03 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.03 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.71 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.03 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.77 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1803  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 
95 aa  44.7  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  33.9 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0414  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.34 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.09 
 
 
103 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>