158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_3369 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
96 aa  196  9e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  53.85 
 
 
94 aa  101  4e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  49.45 
 
 
94 aa  94.7  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  39.56 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.56 
 
 
102 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.56 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.41 
 
 
99 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.26 
 
 
95 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.64 
 
 
128 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
114 aa  65.5  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
99 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  36.36 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
95 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  33.33 
 
 
112 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.37 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  38.37 
 
 
96 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.48 
 
 
95 aa  60.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 
94 aa  59.7  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 
98 aa  57  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.9 
 
 
99 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.37 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.37 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.37 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
95 aa  56.2  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  34.18 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  36.59 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  36.59 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 
103 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 
104 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  30.12 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.84 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.62 
 
 
104 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
95 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  30.85 
 
 
101 aa  52.8  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  33.71 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.59 
 
 
105 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  33.33 
 
 
98 aa  52.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.53 
 
 
99 aa  52.8  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 
98 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  32.18 
 
 
106 aa  52.8  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
99 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
99 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.8 
 
 
108 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.8 
 
 
108 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.8 
 
 
108 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.8 
 
 
108 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
106 aa  51.6  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.9 
 
 
108 aa  50.8  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.1 
 
 
107 aa  50.4  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
99 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  34.57 
 
 
108 aa  50.4  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 
98 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.85 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.85 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.96 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
96 aa  49.7  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  28.4 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.83 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  32.39 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  26.37 
 
 
98 aa  48.9  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.09 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3506  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
108 aa  47.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  34.18 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
99 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  34.18 
 
 
95 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 
95 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
104 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
99 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.97 
 
 
96 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 
94 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
104 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 
94 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1144  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.32 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  0.57363 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>