169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2481 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  229  7.000000000000001e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.21 
 
 		 114 aa  144  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  51.76 
 
 		 98 aa  90.5  6e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.36 
 
 		 97 aa  88.2  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  44.57 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.86 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.94 
 
 		 96 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.22 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.22 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.22 
 
 		 96 aa  72  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.17 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  42.17 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  42.17 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.22 
 
 		 96 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.74 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.88 
 
 		 99 aa  65.5  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  38.1 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.26 
 
 		 95 aa  63.9  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.58 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.14 
 
 		 99 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 		 97 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 96 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.73 
 
 		 102 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.25 
 
 		 95 aa  61.6  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  35.71 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.47 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.06 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.05 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  34.02 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  34.02 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  36.05 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.09 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.91 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  36.71 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1075  hypothetical protein  35.48 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1906  lipoprotein  35.48 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.9 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.48 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.48 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.48 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.48 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.48 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.16 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.74 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  34.78 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.76 
 
 		 95 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  38.96 
 
 		 96 aa  55.5  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.97 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  34.18 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.52 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2577  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.05 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  31.4 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.38 
 
 		 110 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.59 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  29.27 
 
 		 94 aa  53.5  0.0000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.91 
 
 		 104 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 		 98 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  32.88 
 
 		 94 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.23 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 		 106 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.96 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21560  hypothetical protein  30 
 
 		 104 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.8 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 96 aa  52  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2120  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.02 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.02 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.02 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12762  hypothetical protein  35.85 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.21885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.57 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.68 
 
 		 99 aa  51.6  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.65 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.57 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.74 
 
 		 104 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 		 94 aa  50.4  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.83 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1401  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.21 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.35 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  36.23 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  30.86 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  28.05 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3268  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.94 
 
 		 120 aa  48.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68542  normal  0.310475 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 99 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>