136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6672 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
95 aa  197  5e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.55 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.11 
 
 
99 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.79 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4618  hypothetical protein  40.48 
 
 
92 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.35 
 
 
94 aa  62  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  35 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.98 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.35 
 
 
106 aa  61.6  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.09 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.09 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.09 
 
 
94 aa  60.8  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.09 
 
 
99 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 
99 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.53 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  38.75 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.09 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.16 
 
 
94 aa  58.9  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 
99 aa  58.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.88 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 
99 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  29.79 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.33 
 
 
96 aa  57.8  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.04 
 
 
96 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.04 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.04 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.04 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  37.5 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.41 
 
 
96 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 
106 aa  55.8  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
95 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.9 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  40 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.4 
 
 
110 aa  54.3  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.81 
 
 
103 aa  54.3  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.26 
 
 
114 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
96 aa  53.9  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.71 
 
 
95 aa  53.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.71 
 
 
95 aa  53.5  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
95 aa  53.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  35.14 
 
 
96 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
99 aa  53.5  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.54 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.88 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.47 
 
 
100 aa  51.6  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.53 
 
 
95 aa  51.2  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 
99 aa  50.4  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12762  hypothetical protein  31.87 
 
 
104 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.21885 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.91 
 
 
95 aa  50.4  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07090  hypothetical protein  31.58 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  38.89 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.73 
 
 
107 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  29.35 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.92 
 
 
94 aa  48.9  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.35 
 
 
104 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
106 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
99 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.59 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  32.5 
 
 
96 aa  47.4  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
102 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  36.92 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  28.57 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21560  hypothetical protein  36.05 
 
 
104 aa  47  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 
148 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  36.11 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.79 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  31.18 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.74 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.75 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.24 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1714  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
116 aa  45.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00170627  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3995  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.74 
 
 
104 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.261121 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 
96 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3001  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 
93 aa  44.7  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.107557  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
99 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.88 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.71 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.59 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.59 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.68 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>