212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2446 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  100 
 
 
96 aa  197  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.06 
 
 
99 aa  105  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
110 aa  90.5  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.68 
 
 
99 aa  86.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.75 
 
 
95 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.96 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.43 
 
 
96 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.08 
 
 
100 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.59 
 
 
100 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  46.75 
 
 
96 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.98 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  49.3 
 
 
96 aa  73.2  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.23 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.54 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.98 
 
 
95 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  39.02 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.1 
 
 
97 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.36 
 
 
96 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.23 
 
 
106 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  35.71 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.11 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  37.63 
 
 
96 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.7 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
96 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.06 
 
 
96 aa  67  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.67 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 
96 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.48 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.57 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.93 
 
 
102 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.71 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.56 
 
 
96 aa  63.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.68 
 
 
94 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.94 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.3 
 
 
107 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
94 aa  62  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
94 aa  61.6  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
94 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
98 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 
97 aa  60.5  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
94 aa  60.5  0.000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  36.46 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  36.46 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.46 
 
 
95 aa  59.7  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.62 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  35.62 
 
 
106 aa  58.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3995  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.16 
 
 
104 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.261121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  37.5 
 
 
97 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 
104 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  37.5 
 
 
97 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 
96 aa  58.2  0.00000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.03 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.96 
 
 
99 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  32.05 
 
 
94 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  36.99 
 
 
98 aa  57.4  0.00000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
95 aa  57  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  29.79 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  34.48 
 
 
102 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  30.77 
 
 
94 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.66 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2577  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  36.17 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.72 
 
 
99 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.71 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1075  hypothetical protein  35.11 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1906  lipoprotein  35.11 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  32.91 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.11 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.11 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.11 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.11 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.11 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
97 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 
104 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.52 
 
 
95 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.17 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  34.78 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 
95 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.03 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.66 
 
 
107 aa  53.1  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.85 
 
 
99 aa  52  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  29.76 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 
94 aa  52.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>