99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_21560 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_21560  hypothetical protein  100 
 
 
104 aa  212  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.95 
 
 
103 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.68 
 
 
98 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.9 
 
 
104 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  33.02 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 
104 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.74 
 
 
103 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.56 
 
 
104 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.56 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  34.74 
 
 
101 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.16 
 
 
99 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
114 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.68 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
99 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  33.68 
 
 
128 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 
95 aa  53.9  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 
106 aa  53.9  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  38.57 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.41 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.72 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.05 
 
 
102 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  31 
 
 
102 aa  52  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  30 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  36.84 
 
 
96 aa  52  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  37.33 
 
 
96 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 
106 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.91 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  35.9 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 
99 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 
95 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  36.99 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04800  hypothetical protein  29.67 
 
 
103 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.574868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  32.53 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.41 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.41 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  33.68 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.98 
 
 
107 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.33 
 
 
96 aa  47  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
99 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.05 
 
 
95 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.99 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
148 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07090  hypothetical protein  33.87 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  32.81 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.81 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  32.81 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.4 
 
 
112 aa  45.1  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  27.27 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.6 
 
 
94 aa  43.9  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0846  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.07 
 
 
103 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
94 aa  43.5  0.0009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.87 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  35.14 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  34.21 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.96 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  34.21 
 
 
97 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0214  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.43 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 
99 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 
99 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1803  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 
97 aa  42  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4618  hypothetical protein  23.94 
 
 
92 aa  42  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.131861  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
94 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.51 
 
 
95 aa  42  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.49 
 
 
100 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 
96 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2120  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 
103 aa  41.2  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  41.82 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1906  lipoprotein  41.82 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  41.82 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  41.82 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  41.82 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  41.82 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1075  hypothetical protein  41.82 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.79 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  37.84 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 
96 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  36.84 
 
 
94 aa  40  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.81 
 
 
96 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>