24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_04800 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_04800  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  207  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.574868  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07090  hypothetical protein  70.87 
 
 
103 aa  147  5e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3607  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.54 
 
 
103 aa  96.3  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.89 
 
 
104 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0846  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.95 
 
 
103 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3995  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.98 
 
 
104 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.261121 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.07 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.07 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2120  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.07 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.89 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12762  hypothetical protein  32.04 
 
 
104 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.21885 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21560  hypothetical protein  29.67 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.71 
 
 
103 aa  51.6  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0205847  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  28.26 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  30.49 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000542689 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  24.73 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  34.25 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.99 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3067  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.91 
 
 
92 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.299855  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 
110 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
80 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>