123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12430 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  219  9.999999999999999e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21560  hypothetical protein  33.02 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  38.1 
 
 
112 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
106 aa  62.8  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
106 aa  60.1  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.05 
 
 
107 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.68 
 
 
114 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 
103 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.82 
 
 
96 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  35.71 
 
 
98 aa  55.5  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  34.25 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  34.25 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.81 
 
 
95 aa  54.7  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.21 
 
 
97 aa  54.3  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.06 
 
 
99 aa  53.9  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.76 
 
 
94 aa  52.4  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 
112 aa  52.4  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 
104 aa  52  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.24 
 
 
96 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.59 
 
 
107 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 
103 aa  51.2  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2210  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  26.67 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 
102 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  35.62 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
95 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.33 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.84 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.21 
 
 
99 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.61 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 
110 aa  47.4  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
96 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  27.27 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1075  hypothetical protein  32.94 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1906  lipoprotein  32.94 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
104 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2120  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.6 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.6 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  32.94 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  32.94 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  32.94 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  32.94 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.6 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  32.94 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  24.18 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 
80 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
102 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3791  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.47 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2577  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  32.94 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.36 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  30.77 
 
 
98 aa  44.7  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04800  hypothetical protein  30.49 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.574868  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  26.37 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.68 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  33.33 
 
 
95 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.74 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3875  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.47 
 
 
101 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.988198 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07090  hypothetical protein  30.11 
 
 
103 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
105 aa  43.5  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  29.58 
 
 
96 aa  43.5  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.27 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  26.32 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3995  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.53 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.261121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.74 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.27 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.26 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  21.69 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  21.69 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  28.95 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  28.95 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.88 
 
 
106 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  20.48 
 
 
94 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.76 
 
 
108 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  21.95 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
106 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.38 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  21.95 
 
 
94 aa  41.6  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4464  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.293182  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>