141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5035 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
96 aa  197  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.46 
 
 
96 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.79 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.79 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.79 
 
 
96 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.61 
 
 
96 aa  61.2  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.74 
 
 
96 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2577  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  37.5 
 
 
96 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  33.68 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.44 
 
 
114 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
98 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.61 
 
 
96 aa  59.3  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.52 
 
 
97 aa  58.2  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1075  hypothetical protein  35.42 
 
 
96 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1906  lipoprotein  35.42 
 
 
96 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.42 
 
 
96 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.42 
 
 
96 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.42 
 
 
96 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.42 
 
 
96 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  35.42 
 
 
96 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.02 
 
 
98 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  27.71 
 
 
98 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.56 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 
96 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.94 
 
 
100 aa  56.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.91 
 
 
80 aa  55.5  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  32.97 
 
 
112 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.97 
 
 
107 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  29.17 
 
 
96 aa  53.9  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.63 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  33.75 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.75 
 
 
99 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  38.71 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.47 
 
 
95 aa  52.8  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
95 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.97 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.84 
 
 
103 aa  52.8  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
101 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 
96 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 
99 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  31.52 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.82 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.23 
 
 
94 aa  51.2  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 
100 aa  51.2  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.66 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.85 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  29.63 
 
 
94 aa  50.8  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 
94 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 
94 aa  49.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  29.35 
 
 
108 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 
94 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  29.17 
 
 
95 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  29.17 
 
 
95 aa  49.7  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
95 aa  49.7  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 
108 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 
94 aa  48.9  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  32.05 
 
 
96 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  27.91 
 
 
105 aa  47.4  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 
94 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 
95 aa  47  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.6 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.89 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.07 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2777  hypothetical protein  30.26 
 
 
102 aa  45.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
94 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  28.87 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  22.99 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2120  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  27.17 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  27.16 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2166  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0310747  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2392  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0294565 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2107  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.253753  normal  0.0667442 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  27.17 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.36 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>