137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1195 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1195  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 95 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  44.12 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0948  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.07 
 
 		 115 aa  55.1  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.18 
 
 		 99 aa  54.7  0.0000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  27.17 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.26 
 
 		 95 aa  53.9  0.0000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.74 
 
 		 101 aa  53.9  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3852  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.38 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.108914  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1214  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.03 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.85027  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  38.27 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0087  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.12 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4261  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.18 
 
 		 102 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.899897  hitchhiker  0.000276374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  31.11 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  35.53 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 		 94 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3432  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.2 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  32.47 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.55 
 
 		 99 aa  49.3  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3791  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 		 101 aa  49.7  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0966  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.77 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.472175  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1513  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.76 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.289391  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.35 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3875  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 		 101 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.988198 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3317  quinol monooxygenase YgiN  35.16 
 
 		 104 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0938653 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.85 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  50 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02901  quinol monooxygenase  35.96 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0671  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.96 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 		 98 aa  47.8  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 100 aa  47.4  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3207  quinol monooxygenase YgiN  35.96 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3493  quinol monooxygenase YgiN  35.96 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0668  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.96 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00541585 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02851  hypothetical protein  35.96 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3462  quinol monooxygenase YgiN  35.96 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4337  quinol monooxygenase YgiN  35.96 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0076  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.48 
 
 		 95 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3437  hypothetical protein  37.35 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.368327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3430  hypothetical protein  37.35 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3365  protein YgiN  37.35 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3361  protein YgiN  37.35 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.218693  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3532  hypothetical protein  37.35 
 
 		 104 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  34.18 
 
 		 112 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.1 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.49 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.49 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0214  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 104 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  32.39 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.49 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.04 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1803  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.32 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2292  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1296  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 		 102 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.670301 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.37 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 		 110 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2802  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.21 
 
 		 94 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  31.71 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.32 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  34.38 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  34.38 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  29.49 
 
 		 101 aa  43.5  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  31.15 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  45.95 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.95 
 
 		 95 aa  42.7  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  39.62 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3607  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 94 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.3 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  39.62 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  32.35 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.18 
 
 		 148 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.35 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.25 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>