98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0527 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  100 
 
 		 108 aa  224  3e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  96.26 
 
 		 108 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  96.26 
 
 		 108 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  96.26 
 
 		 108 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  95.37 
 
 		 108 aa  217  3e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  96.26 
 
 		 108 aa  218  3e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  93.52 
 
 		 108 aa  216  1e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  91.59 
 
 		 108 aa  208  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3506  antibiotic biosynthesis monooxygenase  90.65 
 
 		 108 aa  207  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  76.7 
 
 		 105 aa  173  8e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  74.04 
 
 		 105 aa  165  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.47 
 
 		 117 aa  60.5  0.000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.19 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  40.32 
 
 		 94 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.44 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0932  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 		 116 aa  55.5  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.127938  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2799  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.8 
 
 		 115 aa  55.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.584286  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.76 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1714  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 		 116 aa  51.2  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00170627  normal  0.46336 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 		 94 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 		 100 aa  51.2  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.31 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 		 96 aa  50.4  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.49 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.31 
 
 		 94 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.35 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  39.06 
 
 		 94 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.82 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2700  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.420345  normal  0.0225241 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3268  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 		 120 aa  47  0.00008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.68542  normal  0.310475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.87 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  35.14 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 		 101 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.68 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.88 
 
 		 94 aa  44.3  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.68 
 
 		 128 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0414  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.21 
 
 		 92 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.76 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  32.76 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  32.76 
 
 		 95 aa  43.5  0.0009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3638  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.69 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.84 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.11 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 		 107 aa  43.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  31.25 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  31.25 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.47 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.51 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1187  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  32.84 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3607  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.58 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3609  hypothetical protein  32.39 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.26 
 
 		 98 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.96 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1144  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 		 107 aa  42.7  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  0.57363 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2577  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  32.14 
 
 		 96 aa  42  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1906  lipoprotein  32.14 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.88 
 
 		 101 aa  42  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1075  hypothetical protein  32.14 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3791  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29 
 
 		 101 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1519  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  32.14 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.188497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0186  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  32.14 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0268773  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1728  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  32.14 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1750  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  32.14 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0980  antibiotic biosynthesis monooxygenase family protein  32.14 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.105303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 		 96 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  28.57 
 
 		 96 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.95 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3875  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 101 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.988198 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.33 
 
 		 114 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.38 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  33.77 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.05 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.58 
 
 		 103 aa  40.4  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>