154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2236 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
97 aa  200  6e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.58 
 
 
97 aa  102  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1187  antibiotic biosynthesis monooxygenase  53.12 
 
 
97 aa  99.4  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.3 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.91 
 
 
111 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.07 
 
 
95 aa  67.4  0.00000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.56 
 
 
96 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
111 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.76 
 
 
114 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
111 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3918  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 
111 aa  58.2  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0584952  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3411  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 
111 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 
128 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  42.03 
 
 
98 aa  53.9  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.62 
 
 
96 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  35.14 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.75 
 
 
97 aa  52.4  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0526  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.8 
 
 
108 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 
110 aa  52  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
99 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 
96 aa  51.2  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  38.1 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
99 aa  50.8  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 
102 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  34.29 
 
 
95 aa  50.8  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3506  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  36.11 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.03 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  32.88 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  33.33 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 
109 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  36.11 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  30.56 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
106 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.17 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.62 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 
95 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 
107 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  33.82 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
108 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
100 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  35.21 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  33.33 
 
 
105 aa  48.1  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  31.94 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  30.56 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  30.56 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  30.56 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  33.33 
 
 
108 aa  47.4  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  36.62 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 
94 aa  47  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 
94 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3337  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 
108 aa  47  0.00009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  47  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 
94 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  28 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.67 
 
 
96 aa  46.2  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 
108 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  34.41 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  30.56 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.19 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  31.88 
 
 
107 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  30.14 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  30.14 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  30.14 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3609  hypothetical protein  31.03 
 
 
100 aa  45.8  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  30.56 
 
 
97 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4617  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.68 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  32.39 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  30.14 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.81 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
100 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>