21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3609 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_3609  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  208  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2276  hypothetical protein  62.12 
 
 		 67 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.101209  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  33.73 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 108 aa  42.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 		 104 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  32.39 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0414  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.36 
 
 		 92 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  32.73 
 
 		 94 aa  41.2  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.51 
 
 		 94 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0405  hypothetical protein  29.33 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.96 
 
 		 101 aa  40  0.01  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>