70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A4295 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  100 
 
 
109 aa  226  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  100 
 
 
109 aa  226  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  99.08 
 
 
109 aa  225  1e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  100 
 
 
97 aa  204  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  100 
 
 
97 aa  204  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2128  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  80.21 
 
 
96 aa  169  9e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.254894  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2140  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  80.21 
 
 
96 aa  169  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1654  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  80.21 
 
 
96 aa  169  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2131  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  80.21 
 
 
96 aa  169  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.840351  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01486  hypothetical protein  80.21 
 
 
96 aa  169  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01475  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  80.21 
 
 
96 aa  169  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1600  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  79.17 
 
 
96 aa  166  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  79.17 
 
 
96 aa  163  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  79.17 
 
 
96 aa  163  5.9999999999999996e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  79.17 
 
 
96 aa  163  5.9999999999999996e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  76.04 
 
 
97 aa  158  3e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  66.67 
 
 
97 aa  143  7.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  52.08 
 
 
100 aa  120  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.96 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  43.96 
 
 
102 aa  88.6  3e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  31.91 
 
 
272 aa  73.2  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
110 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.48 
 
 
101 aa  66.2  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 
95 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  40.24 
 
 
117 aa  58.9  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.94 
 
 
100 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  34.94 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  34.94 
 
 
100 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_8324  predicted protein  35.29 
 
 
68 aa  52.8  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0204  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0214  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.91 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  30 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  31.82 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2265  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 
98 aa  48.5  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369863  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.53 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  34.85 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.74 
 
 
106 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  30.3 
 
 
97 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  27.37 
 
 
97 aa  47  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  30.3 
 
 
97 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  30.3 
 
 
97 aa  47  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  30.3 
 
 
97 aa  47  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3536  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
210 aa  47  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55140  hypothetical protein  34.48 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000327578 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  27.5 
 
 
97 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 
98 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  30.3 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  20.73 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
110 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 
100 aa  42  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.25 
 
 
95 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39960  hypothetical protein  28.36 
 
 
254 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.228774  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.04 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.93 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 
106 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.17 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1187  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 
97 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  40.4  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.81 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0841  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.88 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.17 
 
 
95 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  37.04 
 
 
128 aa  40.4  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>