60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0252 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 101 aa  207  3e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  62.63 
 
 		 117 aa  130  7.999999999999999e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.38 
 
 		 110 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  41.67 
 
 		 272 aa  78.6  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  37.11 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  39.58 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  39.58 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  39.58 
 
 		 109 aa  70.1  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  39.58 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  39.58 
 
 		 97 aa  70.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  36.46 
 
 		 97 aa  69.3  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  36.46 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  36.46 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  36.46 
 
 		 96 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 		 106 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2128  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.46 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.254894  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2131  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  36.46 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.840351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1654  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  36.46 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2140  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  36.46 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01486  hypothetical protein  36.46 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01475  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  36.46 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1600  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  36.46 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.9 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.35 
 
 		 100 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.18 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  40 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.18 
 
 		 100 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.74 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.53 
 
 		 110 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  38.82 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0204  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.99 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  28.42 
 
 		 102 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 		 110 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  25.77 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.67 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.21 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.81 
 
 		 97 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_8324  predicted protein  31.82 
 
 		 68 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.33 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0841  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.68 
 
 		 137 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2430  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.7 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  32.39 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.34 
 
 		 99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 		 100 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55140  hypothetical protein  34.21 
 
 		 98 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000327578 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.9 
 
 		 97 aa  42  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  29.58 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0418  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  hitchhiker  0.00133248 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  36.73 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1276  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 		 148 aa  40  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.484559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>