85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2006 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 108 aa  225  2e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  71.3 
 
 		 110 aa  173  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  70.75 
 
 		 108 aa  164  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1870  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  68.52 
 
 		 109 aa  159  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.98 
 
 		 112 aa  152  1e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10140  hypothetical protein  59.43 
 
 		 106 aa  137  6e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.75 
 
 		 106 aa  137  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11140  hypothetical protein  53.27 
 
 		 107 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.14 
 
 		 106 aa  130  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22480  hypothetical protein  55.66 
 
 		 106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.34 
 
 		 106 aa  124  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  51.89 
 
 		 107 aa  113  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  46.15 
 
 		 107 aa  110  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  43.27 
 
 		 107 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  37.38 
 
 		 107 aa  80.5  0.000000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.96 
 
 		 109 aa  70.9  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  29.55 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 		 99 aa  53.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 		 99 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 110 aa  52.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.24 
 
 		 99 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  28.41 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.56 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  34.29 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 		 114 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 		 99 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  30.49 
 
 		 97 aa  47.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  29.21 
 
 		 94 aa  47.4  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 		 110 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  22.47 
 
 		 95 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  30.49 
 
 		 97 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  41.56 
 
 		 98 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.74 
 
 		 96 aa  47  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  31.03 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.14 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  30.12 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  29.27 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  31.76 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3393  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.32 
 
 		 99 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  29.27 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  29.27 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  29.27 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.44 
 
 		 97 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.32 
 
 		 99 aa  43.9  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.51 
 
 		 101 aa  44.3  0.0006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 104 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  34.18 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  30.53 
 
 		 112 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  25.84 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  29.27 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  25.58 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.88 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.88 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.4 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.88 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.26 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.05 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  29.27 
 
 		 97 aa  42  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  28.05 
 
 		 97 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  32.89 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.81 
 
 		 104 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  22.99 
 
 		 96 aa  41.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.59 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 		 95 aa  41.2  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.09 
 
 		 95 aa  40.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.81 
 
 		 104 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0214  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.189579 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 		 98 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 97 aa  40  0.01  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>