46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4062 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
109 aa  225  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  43.93 
 
 
107 aa  100  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  42.99 
 
 
107 aa  100  6e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22480  hypothetical protein  45.71 
 
 
106 aa  89.7  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  45.79 
 
 
107 aa  88.6  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.9 
 
 
110 aa  87.4  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.06 
 
 
106 aa  80.9  0.000000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11140  hypothetical protein  40.19 
 
 
107 aa  80.5  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.74 
 
 
106 aa  80.5  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10140  hypothetical protein  38.68 
 
 
106 aa  77  0.00000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.57 
 
 
112 aa  74.7  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.19 
 
 
108 aa  74.3  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
107 aa  71.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 
106 aa  70.9  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.96 
 
 
108 aa  70.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1870  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.19 
 
 
109 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  28.41 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.23 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3393  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.03 
 
 
110 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.1 
 
 
106 aa  44.3  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  26.74 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.99 
 
 
114 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 
101 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.51 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.88 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  26.51 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 
102 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  31.33 
 
 
117 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.59 
 
 
97 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  27.38 
 
 
97 aa  42  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  28.41 
 
 
99 aa  41.6  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.68 
 
 
103 aa  41.2  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3536  antibiotic biosynthesis monooxygenase  21.1 
 
 
210 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  32.58 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.47 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0616  hypothetical protein  28.99 
 
 
128 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.501171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 
110 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 
99 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.87 
 
 
110 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 
114 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>