73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_10140 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_10140  hypothetical protein  100 
 
 
106 aa  218  1.9999999999999999e-56  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22480  hypothetical protein  78.3 
 
 
106 aa  174  3e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.21 
 
 
112 aa  149  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.43 
 
 
108 aa  137  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  59.05 
 
 
106 aa  134  4e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  57.14 
 
 
106 aa  129  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1870  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  58.49 
 
 
109 aa  128  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.72 
 
 
110 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.29 
 
 
106 aa  124  3e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  52.34 
 
 
108 aa  120  9e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  51.4 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11140  hypothetical protein  49.06 
 
 
107 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  54.72 
 
 
107 aa  114  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  50 
 
 
107 aa  104  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  48.08 
 
 
107 aa  103  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.68 
 
 
109 aa  77  0.00000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  30.68 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  32.14 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  32.14 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.51 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.51 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.71 
 
 
128 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  36.71 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  30.95 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  30.95 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.9 
 
 
110 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  29.76 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  30.68 
 
 
97 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 
97 aa  49.7  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  29.76 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  29.76 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  29.76 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 
99 aa  47.4  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1130  hypothetical protein  30.95 
 
 
125 aa  47  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2595  hypothetical protein  33.33 
 
 
109 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.34 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.34 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.34 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
99 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.97 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  29.55 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.17 
 
 
95 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
99 aa  44.3  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.99 
 
 
102 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  28.09 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 
95 aa  43.9  0.0008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
102 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.82 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.09 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 
111 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.88 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 
99 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
104 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 
104 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  28.21 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  32.39 
 
 
98 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.72 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 
99 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2265  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.99 
 
 
98 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369863  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  29.21 
 
 
102 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 
98 aa  40  0.01  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>