85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2595 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2595  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  221  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.15 
 
 		 96 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3393  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.89 
 
 		 96 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 		 98 aa  57.4  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.66 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.03 
 
 		 99 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10140  hypothetical protein  34.38 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.03 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.04 
 
 		 97 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.94 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 		 100 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  33.73 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.35 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.35 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.35 
 
 		 99 aa  52.4  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.1 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.58 
 
 		 112 aa  50.8  0.000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.9 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 		 100 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.83 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 		 100 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  35 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  34.92 
 
 		 272 aa  49.7  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  35 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  36.67 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  32.53 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  31.76 
 
 		 102 aa  48.9  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  30.43 
 
 		 117 aa  48.9  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  33.85 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  31.03 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  31.03 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  31.03 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.19 
 
 		 110 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  35 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.71 
 
 		 108 aa  47.8  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 		 106 aa  47.4  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.88 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.89 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.89 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.89 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.89 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  29.89 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.34 
 
 		 108 aa  46.2  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4249  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154683  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  31.67 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  31.67 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  31.67 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  31.67 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.71 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.98 
 
 		 114 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 		 99 aa  45.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22480  hypothetical protein  29.9 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  27.96 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.53 
 
 		 103 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1870  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.34 
 
 		 109 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.71 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  25.26 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  30 
 
 		 97 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 		 110 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  36.11 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.63 
 
 		 102 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  29.79 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 93 aa  42  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.46 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  25.84 
 
 		 96 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55140  hypothetical protein  32.14 
 
 		 98 aa  40.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000327578 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  29.79 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.31 
 
 		 96 aa  40.4  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.11 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  30.56 
 
 		 96 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.31 
 
 		 96 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.31 
 
 		 96 aa  40  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 		 128 aa  40  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.09 
 
 		 95 aa  40  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>