104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1064 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
98 aa  198  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3393  antibiotic biosynthesis monooxygenase  55.21 
 
 
96 aa  104  4e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.05 
 
 
96 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.05 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4249  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.47 
 
 
97 aa  63.2  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154683  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  39.06 
 
 
94 aa  61.6  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  32.63 
 
 
94 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.04 
 
 
102 aa  59.3  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  32.63 
 
 
95 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.07 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.25 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  31.91 
 
 
102 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.17 
 
 
99 aa  54.3  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1910  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 
107 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.98 
 
 
99 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  38.33 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  38.33 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.33 
 
 
95 aa  51.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
96 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 
112 aa  51.2  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
114 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  34.12 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  48.9  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2595  hypothetical protein  31.11 
 
 
109 aa  48.1  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.29 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 
99 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 
110 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  32.88 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 
96 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  32.88 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 
96 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 
98 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  26.97 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 
99 aa  45.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.97 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  32.93 
 
 
96 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.11 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.56 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 
99 aa  45.1  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 
106 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.92 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
111 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.72 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1061  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.44 
 
 
105 aa  42.7  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0397481 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  39.22 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  39.22 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.22 
 
 
95 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3918  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0584952  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0454  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
104 aa  42  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2267  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.29 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  30.77 
 
 
128 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3411  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
111 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.99 
 
 
97 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.88 
 
 
103 aa  42  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5255  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.76 
 
 
102 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.083215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.21 
 
 
96 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.75 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.27 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  28.26 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  34.48 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1525  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  30.11 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  25.29 
 
 
100 aa  41.2  0.005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.38 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 
97 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3067  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.85 
 
 
92 aa  40.8  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.299855  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.44 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0846  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.99 
 
 
103 aa  40.8  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3237  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.03 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000082945  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2577  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  34.92 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277711  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.91 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
100 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2210  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  23.96 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>