136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16970 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  199  9.999999999999999e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.28 
 
 
95 aa  67  0.00000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  32.22 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  31.4 
 
 
107 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 
106 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 
106 aa  58.5  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  30.23 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  40.48 
 
 
95 aa  57.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
101 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.72 
 
 
106 aa  55.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
101 aa  55.1  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.11 
 
 
98 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
97 aa  53.9  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.61 
 
 
96 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
107 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  28.26 
 
 
99 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  36.99 
 
 
95 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 
96 aa  52  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  36.99 
 
 
95 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.99 
 
 
95 aa  52  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.17 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 
97 aa  50.8  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.17 
 
 
99 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0407  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 
97 aa  50.4  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.44 
 
 
99 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.96 
 
 
106 aa  49.7  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.81 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.72 
 
 
93 aa  48.9  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.51 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  35.21 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
94 aa  48.5  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
95 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2210  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  29.79 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 
95 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.92 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.09 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 
94 aa  47.8  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3995  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.26 
 
 
104 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.261121 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  31.03 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 
94 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 
100 aa  47.4  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 
95 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.23 
 
 
112 aa  47  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3638  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 
99 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.96 
 
 
96 aa  47  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  27.38 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  31.43 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.83 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.49 
 
 
95 aa  46.2  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 
96 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  27.54 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 
114 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22480  hypothetical protein  30 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1401  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  28.99 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 
95 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  20.73 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  20.73 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  20.73 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  20.73 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  20.73 
 
 
109 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.74 
 
 
110 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  28.99 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  28.99 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.88 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  29.27 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  28.99 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  26.6 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.4 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  28.99 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.34 
 
 
104 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.74 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  29.85 
 
 
97 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  24.72 
 
 
96 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 
98 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.77 
 
 
96 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  28.99 
 
 
97 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.85 
 
 
97 aa  43.9  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0469  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.71 
 
 
94 aa  43.9  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.33 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.39 
 
 
106 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 
94 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.49 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.58 
 
 
108 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0674  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.48 
 
 
107 aa  42.4  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.495419  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1439  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1600  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  21.33 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 
94 aa  42.7  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.74 
 
 
108 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.26 
 
 
97 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.26 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.58 
 
 
94 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>