150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1332 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 101 aa  212  9.999999999999999e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  89.11 
 
 		 101 aa  191  3e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  78.26 
 
 		 96 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  71.72 
 
 		 99 aa  157  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.04 
 
 		 95 aa  140  9e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  66.32 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  66.32 
 
 		 95 aa  135  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  68.13 
 
 		 95 aa  133  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.48 
 
 		 99 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1381  hypothetical protein  30.95 
 
 		 96 aa  66.6  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0769  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.18 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.33 
 
 		 95 aa  66.6  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  37.5 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.33 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.33 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.45 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 		 95 aa  58.5  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.1 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.04 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.44 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.44 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.44 
 
 		 95 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 		 95 aa  57  0.00000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  35.62 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.04 
 
 		 111 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 		 114 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.62 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.04 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.04 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.04 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.44 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.33 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.49 
 
 		 99 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 100 aa  53.9  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3918  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.04 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0584952  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 		 95 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3411  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.04 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  33.33 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.91 
 
 		 95 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 		 112 aa  52.8  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0164  hypothetical protein  66.67 
 
 		 35 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.38 
 
 		 104 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 		 94 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  40 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4266  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.4 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.326536  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3638  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 		 99 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  30.23 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 		 95 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.65 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  31.65 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  37.84 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0763  hypothetical protein  38.67 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.101689 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.68 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.11 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  38.89 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  38.89 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 		 99 aa  48.1  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.94 
 
 		 97 aa  47.4  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 		 106 aa  47  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 		 103 aa  47  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.94 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0948  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 		 115 aa  46.6  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  32.86 
 
 		 96 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.84 
 
 		 95 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.77 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.17 
 
 		 99 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 		 94 aa  46.2  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 		 105 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 		 98 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  33.93 
 
 		 97 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0527  hypothetical protein  36.84 
 
 		 108 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.71 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.87 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.78 
 
 		 99 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0525  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.82 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1144  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.51 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  0.57363 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  33.93 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.82 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.82 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0997  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.69 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0138004  normal  0.714993 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.82 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.21 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.31 
 
 		 103 aa  44.3  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1439  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 		 98 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>