111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5441 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 114 aa  239  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  67.33 
 
 		 102 aa  145  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2078  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.73 
 
 		 111 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0872273  normal  0.413977 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.33 
 
 		 111 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.33 
 
 		 111 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  66.33 
 
 		 111 aa  136  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3918  antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.78 
 
 		 111 aa  133  9e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0584952  normal  0.536312 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3411  antibiotic biosynthesis monooxygenase  60.78 
 
 		 111 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.194055 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  63.27 
 
 		 111 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5778  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.63 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.21 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 		 96 aa  63.9  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.76 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1187  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 		 97 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441101  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.68 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.54 
 
 		 93 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0667  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 106 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 		 99 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 		 101 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11140  hypothetical protein  32.86 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.23 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.84 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.55 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  34.25 
 
 		 94 aa  52.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 106 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.36 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1870  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 		 109 aa  51.2  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  36.11 
 
 		 96 aa  50.1  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 		 99 aa  49.7  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  35.85 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.29 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.14 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10140  hypothetical protein  35.94 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22480  hypothetical protein  34.33 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  30 
 
 		 94 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.52 
 
 		 95 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  31.76 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.25 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.31 
 
 		 105 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  28.99 
 
 		 107 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.67 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.62 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  28.99 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.76 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.58 
 
 		 95 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0579  hypothetical protein  32.39 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  34.25 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 		 98 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  34.25 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 		 95 aa  45.4  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.52 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.99 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.05 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  32.43 
 
 		 102 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  32.47 
 
 		 107 aa  43.9  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.99 
 
 		 101 aa  43.9  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.43 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 96 aa  42.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 		 106 aa  43.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.95 
 
 		 99 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  33.8 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  32.86 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  28.17 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 128 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1401  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 		 105 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.43 
 
 		 94 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  30.26 
 
 		 97 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  30.26 
 
 		 97 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.67 
 
 		 99 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03616  conserved hypothetical protein  29.89 
 
 		 102 aa  41.2  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00787091  normal  0.148364 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  30.51 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.51 
 
 		 102 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  27.03 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.39 
 
 		 94 aa  41.2  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.5 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>