54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2164 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
96 aa  193  7e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3393  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.45 
 
 
96 aa  90.9  5e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.130883 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.05 
 
 
98 aa  80.5  0.000000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5004  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.86 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.610336  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2595  hypothetical protein  46.67 
 
 
109 aa  62  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.833158 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  33.68 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  32.63 
 
 
97 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  33.68 
 
 
97 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  32.63 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  32.63 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  32.63 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  32.63 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  32.63 
 
 
97 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16970  hypothetical protein  32.61 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.98 
 
 
99 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  31.82 
 
 
102 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  33.68 
 
 
97 aa  50.1  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
102 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2068  hypothetical protein  32.22 
 
 
96 aa  50.1  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00313033  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.98 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1144  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  0.57363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.97 
 
 
96 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.91 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.04 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.91 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4249  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.61 
 
 
97 aa  45.4  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.154683  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2265  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.47 
 
 
98 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369863  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5441  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
114 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7008  hypothetical protein  32.61 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.560667 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.63 
 
 
99 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8702  hypothetical protein  30.68 
 
 
107 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.88 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.78 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10140  hypothetical protein  35.09 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.34 
 
 
94 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.17 
 
 
106 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8673  hypothetical protein  28.41 
 
 
107 aa  42  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  29.55 
 
 
94 aa  41.2  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  29.17 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2461  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.09 
 
 
107 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.53 
 
 
95 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2267  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1600  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 
112 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.372361  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03040  hypothetical protein  32.58 
 
 
107 aa  40.8  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 
96 aa  40.8  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1256  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.14 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0675  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
106 aa  40  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.59 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  28.24 
 
 
100 aa  40  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>