111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0824 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4617  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.57 
 
 
104 aa  77  0.00000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  32.26 
 
 
102 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
102 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
94 aa  58.2  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  32.14 
 
 
94 aa  57  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  41.1 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  41.1 
 
 
97 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 
99 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1064  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.07 
 
 
98 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.99 
 
 
95 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 
148 aa  54.7  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.46 
 
 
99 aa  52  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.44 
 
 
100 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.73 
 
 
99 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  35.37 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.67 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 
95 aa  50.8  0.000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.460757  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  30.68 
 
 
94 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  30.34 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  29.67 
 
 
128 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.03 
 
 
100 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.71 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  34.57 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.71 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.71 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.71 
 
 
94 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.51 
 
 
94 aa  48.9  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  34.15 
 
 
98 aa  48.9  0.00003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2267  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 
98 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.59 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.58 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.14 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.03 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.56 
 
 
103 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55140  hypothetical protein  42.42 
 
 
98 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000327578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
97 aa  47  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.23 
 
 
101 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  43.64 
 
 
100 aa  47  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 
106 aa  46.2  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2683  hypothetical protein  30.77 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.618339  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
97 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.27 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0389  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.62 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1144  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 
107 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  0.57363 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2265  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.79 
 
 
98 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.369863  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30 
 
 
95 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.89 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1398  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00323232  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.1 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.751157  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4574  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 
111 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210178  normal  0.879884 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5952  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.48 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49186  normal  0.673339 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4717  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.38 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.649718 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3237  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.75 
 
 
95 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000082945  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3005  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
101 aa  46.2  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.48 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.48 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.92 
 
 
104 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.8 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.1 
 
 
97 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.36 
 
 
95 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.16 
 
 
100 aa  43.5  0.0009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.9 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.9 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4018  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.84 
 
 
98 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.409362  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.86 
 
 
110 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2964  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  33.87 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  33.87 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.023578 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3036  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.87 
 
 
95 aa  43.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.398194  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.31 
 
 
99 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1803  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4656  hypothetical protein  33.85 
 
 
126 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2164  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.15 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.142166  normal  0.529282 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2236  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
97 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  24.1 
 
 
98 aa  42.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.07 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1332  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.43 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 
106 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0948  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.34 
 
 
115 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.49 
 
 
99 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.69 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1827  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 
99 aa  41.2  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.758954 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.88 
 
 
97 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2637  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.18 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.51631  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.39 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4371  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.65 
 
 
103 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.85 
 
 
96 aa  41.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4361  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.443758  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4005  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.601713  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3518  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821089  normal  0.461755 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>