202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_0406 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
94 aa  198  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  98.94 
 
 
94 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  79.79 
 
 
94 aa  163  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.15 
 
 
94 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.15 
 
 
94 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.15 
 
 
94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  69.15 
 
 
94 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  67.02 
 
 
94 aa  144  5e-34  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  65.96 
 
 
94 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  44.32 
 
 
96 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.78 
 
 
95 aa  74.3  0.0000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  37.36 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  37.36 
 
 
97 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.08 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.48 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40 
 
 
106 aa  68.2  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  42.31 
 
 
102 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  49.23 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.09 
 
 
95 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.24 
 
 
99 aa  65.5  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  35.8 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.9 
 
 
148 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.65 
 
 
110 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.04 
 
 
99 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.25 
 
 
98 aa  62.8  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.35 
 
 
95 aa  62  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 
97 aa  62.4  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.37 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.04 
 
 
106 aa  61.6  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2817  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.56 
 
 
95 aa  61.2  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.201503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.96 
 
 
97 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  35.8 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.14 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6175  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
106 aa  60.1  0.000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3201  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.85 
 
 
98 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0130262  unclonable  0.0000000000117168 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  38.46 
 
 
96 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2512  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344542  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 
112 aa  58.9  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.52 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 
98 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
95 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 
96 aa  58.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.62 
 
 
98 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35 
 
 
99 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.68 
 
 
96 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.76 
 
 
103 aa  57  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3867  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
95 aa  57  0.00000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0190712 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 
100 aa  57  0.00000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2766  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.14 
 
 
95 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.593447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.75 
 
 
99 aa  55.5  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0502  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.71 
 
 
105 aa  55.5  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0748707  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 
97 aa  55.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.93 
 
 
103 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1897  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
95 aa  55.1  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00347775  hitchhiker  0.000110929 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.53 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1341  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.8 
 
 
97 aa  54.7  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000990152 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.26 
 
 
104 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.57 
 
 
99 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 
106 aa  54.3  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.95 
 
 
96 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2756  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.62 
 
 
96 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  32.93 
 
 
98 aa  53.1  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1604  antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.11 
 
 
99 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714924  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2332  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.84 
 
 
97 aa  53.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0741444 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10809  hypothetical protein  30.68 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000694209  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
104 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  32.47 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06652  hypothetical protein  31.82 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3869  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.85 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.346738  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.82 
 
 
96 aa  52  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.67 
 
 
80 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4294  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
99 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.918403 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 
128 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0401  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  28.57 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0712142 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1676  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.510049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1568  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  28.57 
 
 
95 aa  51.6  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00171921  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.78 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.09 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3962  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.35 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.67 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.434397 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  40.35 
 
 
99 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.508922 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1578  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 
100 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.126729  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3966  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.81 
 
 
108 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3784  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.81 
 
 
108 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0485  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.81 
 
 
108 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.81 
 
 
108 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2481  hypothetical protein  30.14 
 
 
112 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
107 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  35.06 
 
 
96 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03061  hypothetical protein  36.92 
 
 
94 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>