142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3014 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 
148 aa  306  5.9999999999999995e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5219  antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.74 
 
 
100 aa  83.6  9e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.13 
 
 
95 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1037  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.67 
 
 
97 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.673583  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4464  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.66 
 
 
117 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.293182  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1396  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.44 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.340093  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4327  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.44 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.398506 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4416  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.44 
 
 
97 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.814561  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.19 
 
 
99 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3619  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.1 
 
 
94 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0405  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.71 
 
 
94 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00781134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.98 
 
 
95 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2517  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.56 
 
 
106 aa  65.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.910218  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  34.94 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  34.94 
 
 
97 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.9 
 
 
94 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4776  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.61 
 
 
110 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.831592  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0311  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 
99 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1588  hypothetical protein  32.1 
 
 
96 aa  60.5  0.000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.113304  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3649  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.12 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3933  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.33 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.18 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4074  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.33 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.296978 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3881  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.33 
 
 
94 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000774997 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.8 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3958  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
94 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0852  lipoprotein  32.56 
 
 
96 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0257  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.03 
 
 
128 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
96 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2446  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.11 
 
 
106 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3437  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36 
 
 
94 aa  57  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2954  hypothetical protein  29.89 
 
 
128 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.19352  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.59 
 
 
96 aa  55.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0400  hypothetical protein  32.14 
 
 
94 aa  55.1  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 
96 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2446  hypothetical protein  38.78 
 
 
96 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0824  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.841443  normal  0.172785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  35.29 
 
 
96 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 
96 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.49 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 
96 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 
100 aa  53.9  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3239  antibiotic biosynthesis monooxygenase domain-containing protein  35.94 
 
 
98 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.17 
 
 
103 aa  53.5  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2954  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.38 
 
 
112 aa  52.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  31.08 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.33 
 
 
94 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.339758  normal  0.855445 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1406  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.06 
 
 
96 aa  52  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 
96 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1866  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 
99 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138048  normal  0.0354103 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.71 
 
 
102 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.42 
 
 
96 aa  50.8  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33910  Antibiotic biosynthesis monooxygenase protein  28.05 
 
 
98 aa  50.4  0.000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.11717  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 
107 aa  49.7  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38020  putative ntibiotic biosynthesis monooxygenase  32.81 
 
 
135 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0109734  hitchhiker  0.00690857 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2802  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.25 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.200278 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2380  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.48 
 
 
98 aa  49.7  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.96646  normal  0.159549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2292  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.25 
 
 
99 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2182  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2308  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.23 
 
 
96 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2003  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.71 
 
 
98 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.67 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002899  hypothetical protein  31.91 
 
 
94 aa  49.3  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3498  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
99 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.6 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1871  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.05 
 
 
99 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.47 
 
 
94 aa  48.1  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36280  putative antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0215754 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3203  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.38 
 
 
97 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0128799 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.9 
 
 
100 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1803  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.76 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3369  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
96 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.226825  normal  0.261907 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4617  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.88 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.46 
 
 
100 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3237  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.95 
 
 
95 aa  47  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.0000082945  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001135  hypothetical protein  30 
 
 
96 aa  46.6  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21560  hypothetical protein  32.88 
 
 
104 aa  46.2  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6672  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 
95 aa  46.6  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0349  hypothetical protein  33.33 
 
 
94 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3019  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.03 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.149454  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  41.46 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  41.46 
 
 
100 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12430  hypothetical protein  32.56 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.16 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22850  hypothetical protein  37.1 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.81234  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1614  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.88 
 
 
95 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0217378  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6125  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 
108 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440027  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  28.4 
 
 
98 aa  45.1  0.0003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.21 
 
 
99 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.02 
 
 
100 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.76 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1481  antibiotic biosynthesis monooxygenase  24.44 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0336514  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6821  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.24 
 
 
96 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.73 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1684  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.25 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  30 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>