77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38325 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  100 
 
 
117 aa  244  4e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  64.44 
 
 
101 aa  120  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  50.48 
 
 
110 aa  112  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_92362  predicted protein  47.12 
 
 
272 aa  95.9  2e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.038448  normal  0.165435 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  43.96 
 
 
97 aa  71.6  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  41.3 
 
 
97 aa  70.1  0.000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2128  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  42.68 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.254894  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01486  hypothetical protein  42.68 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2131  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  42.68 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.840351  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1654  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  42.68 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2140  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  42.68 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01475  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  42.68 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1600  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  42.68 
 
 
96 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  39.33 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  39.33 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  39.33 
 
 
96 aa  62  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  48.05 
 
 
100 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.14 
 
 
106 aa  61.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.75 
 
 
100 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  46.75 
 
 
97 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  40.24 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  40.24 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  40.24 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  39.76 
 
 
100 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  40.24 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.45 
 
 
100 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  40.24 
 
 
97 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  38.55 
 
 
100 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  44.78 
 
 
97 aa  53.5  0.0000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  45.07 
 
 
100 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2207  hypothetical protein  26.09 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000589169  hitchhiker  6.1187300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2760  hypothetical protein  23.91 
 
 
97 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3030  hypothetical protein  23.91 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2825  hypothetical protein  23.91 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.106743  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3039  hypothetical protein  23.91 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.843525  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3507  hypothetical protein  37.88 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.02 
 
 
110 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3069  hypothetical protein  25 
 
 
97 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.216709  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3074  hypothetical protein  25 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.126641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3043  hypothetical protein  23.91 
 
 
97 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3152  antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.88 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.756738  normal  0.106564 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2797  hypothetical protein  22.83 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.361189  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1487  antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.86 
 
 
96 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3167  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.35 
 
 
98 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.347958  normal  0.104633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2826  antibiotic biosynthesis monooxygenase  22.83 
 
 
97 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.220348  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  31.46 
 
 
100 aa  47.8  0.00006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  44.26 
 
 
96 aa  47.4  0.00007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0774  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.43 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.924912  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1509  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.58 
 
 
110 aa  46.2  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1463  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.63 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  30.43 
 
 
96 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.24 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  36.14 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.02 
 
 
96 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.35 
 
 
96 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5010  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.89 
 
 
108 aa  44.3  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.272742  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0204  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.96 
 
 
99 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1144  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.91 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.976851  normal  0.57363 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2006  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.18 
 
 
108 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0538  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.73 
 
 
106 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.894063  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.37 
 
 
109 aa  43.5  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4628  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.4 
 
 
96 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.156354  normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_8324  predicted protein  38.3 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.817984  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0851  hypothetical protein  28.92 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.62 
 
 
96 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4524  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.59 
 
 
104 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.451369  normal  0.693828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4662  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.59 
 
 
104 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.134123  normal  0.994103 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4062  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.33 
 
 
109 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4657  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.48 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.494563  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.5 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0841  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.81 
 
 
137 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2718  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.37 
 
 
128 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4798  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.67 
 
 
96 aa  40.8  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0786747  hitchhiker  0.00170038 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.57 
 
 
101 aa  40.4  0.008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  27.96 
 
 
102 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>