57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0204 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0204  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 99 aa  208  2e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1575  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.53 
 
 		 106 aa  69.7  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6277  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  37.5 
 
 		 97 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000255974  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3526  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  38.1 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0863  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  38.1 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3655  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  38.1 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1600  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.67 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.895383  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1875  antibiotic biosynthesis monooxygenase  41.03 
 
 		 252 aa  52.8  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4478  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4325  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4295  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4410  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 		 109 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.266111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4408  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 		 97 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.884642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0564  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 110 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0547682  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1654  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.67 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.282836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2140  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.67 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2131  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.67 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.840351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01486  hypothetical protein  33.67 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2128  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.67 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.254894  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01475  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.67 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1703  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.12592 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3392  hypothetical protein  29.47 
 
 		 96 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 105 aa  51.6  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20250  hypothetical protein  34.12 
 
 		 100 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.25525  normal  0.833496 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1741  hypothetical protein  34.12 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4706  antibiotic biosynthesis monooxygenase  35.29 
 
 		 100 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.26 
 
 		 95 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4571  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.12 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.683113  normal  0.464576 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3531  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  31.31 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.291132 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6899  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.85 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0491  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.1 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4705  antibiotic biosynthesis monooxygenase  38.16 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.190187  normal  0.040711 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0535  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.41 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.494763  normal  0.309514 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1383  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0252  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.72 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0727  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.94 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.235106  normal  0.0173261 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0418  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  30.95 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  hitchhiker  0.00133248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0437  hypothetical protein  28.57 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1743  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.69 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6125  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440027  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38325  predicted protein  31.96 
 
 		 117 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.910141  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0385  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.55 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0306824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2501  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.180823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0840  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.41 
 
 		 129 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0327839 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2833  hypothetical protein  25.81 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.152682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.4 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1619  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.53 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.445975 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2330  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.09 
 
 		 106 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000961496  hitchhiker  0.0000858086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4364  antibiotic biosynthesis monooxygenase  43.75 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0056  autoinducer-2 (AI-2) modifying protein LsrG  33.33 
 
 		 100 aa  42  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.140027  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1816  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.06 
 
 		 104 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.148462  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  22.83 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1768  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.66 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.523558  normal  0.107409 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2453  antibiotic biosynthesis monooxygenase  23.4 
 
 		 96 aa  40  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.237842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1842  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.41 
 
 		 96 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0851122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5035  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28.12 
 
 		 96 aa  40  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>