23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_6125 on replicon NC_012792
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012792  Vapar_6125  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  100 
 
 		 108 aa  224  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440027  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4239  antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.87 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.467888 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5647  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.1 
 
 		 97 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0667  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.18 
 
 		 97 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0704  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.33 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.392341  normal  0.495385 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0640  antibiotic biosynthesis monooxygenase  26.19 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.83774  hitchhiker  0.00200112 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3744  antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.22 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3580  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.52 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3014  antibiotic biosynthesis monooxygenase  34.21 
 
 		 148 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704493 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3499  antibiotic biosynthesis monooxygenase  33.72 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0204  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.27 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0666  antibiotic biosynthesis monooxygenase  28 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3835  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.4 
 
 		 101 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.409935  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1578  hypothetical protein  30.23 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.594105  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18180  hypothetical protein  30.23 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0569  antibiotic biosynthesis monooxygenase  25.58 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1865  antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.56 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237236  normal  0.0159656 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0418  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.52 
 
 		 104 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.324945  hitchhiker  0.00133248 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0519  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  29.07 
 
 		 96 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2608  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.66 
 
 		 103 aa  40.8  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0123227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2795  antibiotic biosynthesis monooxygenase  27.63 
 
 		 100 aa  40.8  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4181  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  32.14 
 
 		 99 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3687  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.08 
 
 		 99 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>